外显子组测序

高效,精准。

高深度搜索编码区遗传信息

外显子组测序(Whole Exome Sequencing,WES)
是利用探针杂交富集外显子区域的DNA序列,通过高通量测序,发现与蛋?#23383;?#21151;能变异相关遗传突变的技术手段。
相比于全基因组测序,外显子组测序更高深度、更加经济、高效。
优势:1. 直接对蛋白编码序列进行测序,?#39029;?#24433;响蛋白结构的变异
    2. 高深度测序,可发现常见变异、低频变异及罕见变异
                                      3. 针对外显子组区域测序,约占基因组的1%,有效降低费用,周期和工作量

高性价,强?#27835;觶?#24555;速交付。

外显子组测序主要用于识别和研究与疾病相关的编码区的基因组变异。
结合大量的公共数据库提供的外显子数据和自建诺禾正常人群数据库, 有利于更好地排除无害突变
及解释变异信息之间的关联和致病机理。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据?#27835;觶?br>每一步都需要科学、缜密的设计,以保?#32454;?#36136;量研究成果。

信息?#27835;?/h3>

?#27835;?#20869;容=标准?#27835;?高级?#27835;觥?br>外显子组测序通过将目标序列与参考序列进行比对,发现外显子组变异信息,
为单基因病和复杂疾病的治疗奠定基础。

疾病基因组学
标准信息?#27835;?/td> 高级信息?#27835;觶?#21333;基因病) 高级信息?#27835;觶?#22797;杂疾病)

1. 数据质控:去除接?#32954;?#26579;和低质量数据
2. 与参考序列进行比对、统计测序深度及
    覆盖度
3. SNP/InDel/CNV 检测、注?#22270;?#32479;计

1. 突变位点筛选结果
2. 显 / 隐性遗传模式?#27835;觶?#38656;客户提供家系信息)
    a 显性遗传模式?#27835;?br>    b 隐性遗传模式?#27835;?br>3. 候选基因功能注释
4. 基因功能及通路?#27835;?br>5. 家系连锁?#27835;?br>6. 纯合子区域(ROH)?#27835;?/p>

1. 突变位点筛选结果
2. 家系显 / 隐性遗传模式?#27835;觶?#38656;客户提供家系信息)
    a 显性遗传模式?#27835;?br>    b 隐性遗传模式?#27835;?br>3. 候选基因功能注释
4. 新生突变筛选及?#27835;觶?#25104;三 / 成四样本)
    a De novo mutation筛选
    b 新生突变速率计算
    c 新生突变速率计算
5. 候选基因功能富集
    样本)
6. 蛋白互作网络?#27835;觶≒PI)
7. 基因显著性?#27835;?br>    (推荐20对Case/Control or trios样本)

癌症基因组学(肿瘤成对样本)
标准信息?#27835;鯝 标准信息?#27835;鯝+ 标准信息?#27835;鯬ro

1. 数据质控:去除接?#32954;?#26579;和低质
    量数据
2. 与参考序列进行比对、统计测序
    深度?#26696;?#30422;度
3. Somatic mutation检测、注释
    及统计(成对样本)

1. 数据质控:去除接?#32954;?#26579;和低质量数据
2. 与参考序列进行比对、统计测序深度?#26696;?#30422;度
3. Somatic SNV/InDel/CNV检测、注?#22270;?#32479;计
    (成对样本)
4. 易感基因筛查
5. 高频突变基因统计及通路富集?#27835;?br>6. NMF突变特征及突变频谱?#27835;?br>7. NovoDriver已知驱动基因筛选

1. MRT高频突变基因相关性?#27835;?br>2. OncodriveCLUST驱动基因预测
3. 突变位点?#26893;?#24773;况?#27835;?br>4. 高频CNV?#27835;?br>5.ABSOLUTE肿瘤纯度及倍性?#27835;?br>6. 杂合性缺失(LOH)?#27835;?br>7. 瘤内异质性及克隆结构?#27835;?br>    a 单样?#31350;?#38534;结构?#27835;觶≒yclone,Expands)
    b 体细胞突变CCF计算
8. NovoDrug高频突变基因靶向用药预测
9. NovoDR耐药突变筛选

了解更多>>

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

基因组测序采用先进的HiSeq 4000测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据?#27835;?#21450;交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目?#26041;冢?#21161;力科学研究。

诺禾致源疾病基因组事业部和癌症基因事业部,致力于精?#23478;?#23398;的科研服务。
结合丰富的项目经验,专业的项目方案指导和?#27835;?#27969;程,保证项目准确并且快速地进行。

自由精神APP