16S、18S、ITS等扩增子测序

产品介绍常见问题经典案例结果展示


16S、18S、ITS等扩增子测序

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一步到位检测环境微生物多样性

扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。
16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域,
通过检测目标区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。
ITS分为两个区域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间,ITS2位于5.8S和28S之间。

读长长, 周期短, 性价比高。

采用 Ion S5 XL 测序平台和 NovaSeq 6000 测序平台。NovaSeq 6000 测序平台通量更高,速度更快,运行时间更短,周期最短可达10天。Ion S5 XL测序平台单端测序,无需拼接,SE400/SE600 两种模式。两种平台,为扩增子测序提供更多的选择。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,?#21592;U细?#36136;量研究成果。

信息分析

分析内容=标准分析+高级分析。
基于目标区域的测序,检测序列丰度,以充分研究环境微生物多样性和
群落结构差异性。

高级分析 解决问题
肠型分析 肠道菌准确定位?#22270;?#30149;预测和治疗
贝?#31471;?#32593;络图 判断微生物之间、微生物和环?#22330;?br/>代谢物间的依赖关系
Source Tracker 样本中微生物群落来源
标准分析 解决问题
物种注释 物种注?#22270;?#21508;物种丰度信息
α-多样性分析 微生物群落的丰富?#32676;?#22810;样性
β-多样性分析 不同样本间的微生物群落
及各样本差异情况
多元统计分析 寻找组间具有显著差异的物种,
同时可以比较组内差异和组间差异
的大小,判断?#32959;?#26159;否有意义
CCA分析 研究物?#32959;?#25104;与环境因子间的关系
环境因子关联分析
VPA分析
功能预测 预测样本的功能组成

扩增子测序解密环境微生物多样性

诺禾致源基于多样性的测序区域选择,结合研究目的和样品自身的特点,
灵活制定研究方案,用专业成熟的样本
制备、建库以及数据分析流程,客观还原样品本身的菌群结构以及丰度。

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

扩增子测序采用先进的Ion S5 XL测序平台和NovaSeq 6000测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
?#21592;?#35777;高效的数据处理和安全的数据存储。

项目经验丰富

至2017年12月,诺禾致源诺禾16S样本数突破220,000例,
包括土壤、水体、粪便、淤泥、发酵物等样本。
“科学的方案设计,?#32454;?#30340;质控管理,专业的分析团队,丰富?#21335;?#30446;经验,优质?#21335;?#30446;服务”
确保每一个?#26041;?#37117;能出色完成,助力科学研究。

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